生物樣本庫絕不僅限于儲存,更重要的含義是資源的應用和共享,利用龐大和詳細的樣本數(shù)據(jù)為人類健康服務。然而,我國的生物樣本庫卻一直傾向于單兵作戰(zhàn),共享機制在國內(nèi)遲遲未能建立。
“沒有信息轉化,生物樣本庫建設意義將成空談。”在全球熱議生物樣本庫之際,其國內(nèi)短板被上海交通大學醫(yī)學院附屬新華醫(yī)院教授王偉業(yè)一語戳中。
生物樣本庫又稱“生物銀行”,但它存儲的不是錢,而是組織、血液、細胞、DNA等生物樣本以及與其相關的臨床資料及其質(zhì)量控制信息管理與應用系統(tǒng)。
王偉業(yè)日前在第二屆生物樣本庫與臨床研究論壇上指出,生物樣本庫絕不僅限于儲存,更重要的含義是資源的應用和共享,利用龐大和詳細的樣本數(shù)據(jù)為人類健康服務。然而,我國的生物樣本庫卻一直傾向于單兵作戰(zhàn),共享機制在國內(nèi)遲遲未能建立。
不該有的“防守”態(tài)度
我國疾病生物樣本資源極其豐富,是任何一個國家無可比擬的。比如,我國一個月的就診數(shù)量就相當于國外幾個月積累的病例數(shù),而整個歐洲的例數(shù)甚至少于我國一家三甲??漆t(yī)院。
目前,我國國家基因庫已經(jīng)擁有3000萬份人、動植物和微生物樣本,被稱為世界級的生物樣本庫和組學數(shù)據(jù)庫。然而,僅有資源完全不夠,生物樣本庫在我國仍呈分散、獨立、無序的狀態(tài)。從樣本庫的質(zhì)量安全控制到信息化資源整合與共享,國內(nèi)與國外存在較大差距。
“我國業(yè)內(nèi)人士在參觀某個生物樣本庫時,總是看有多大空間,多少冰箱,用什么儀器,有幾個人等,信息化問題很少有人關注。”王偉業(yè)稱,樣本資源的應用與研究結合、信息共享為前提的資源共享等問題在國內(nèi)并未得到解決。
在上海交通大學醫(yī)學院附屬精神衛(wèi)生中心教授崔東紅看來,生物樣本庫是個靜態(tài)名詞,這就很可能造成概念上的誤解:如同倉庫一樣只具備儲存功能。
其實,生物樣本庫與傳統(tǒng)生物資源保存最根本的區(qū)別是樣本的信息化,建設現(xiàn)代生物樣本庫的目的也是如何把生物樣本資源轉化或翻譯成可以共享的數(shù)據(jù)信息資源。
“但是,大部分人一談到共享,總會覺得是別人拿了自己的東西,大多采取防守的態(tài)度來回避共享機制的建立。”王偉業(yè)覺得生物樣本庫在國內(nèi)更傾向于單兵作戰(zhàn),殊不知真正能夠展示生物樣本庫價值的是共享信息,及一個有價值和管理規(guī)范的數(shù)據(jù)庫。
“因為有信息,我們才收集樣本;因為可以獲取更有價值的信息,我們才保存樣本;因為樣本和信息可能回答問題,我們才應用樣本。從根本上說,我們使用的是由樣本獲取的數(shù)據(jù)信息。”王偉業(yè)說。
如何讓沙子變黃金
數(shù)據(jù)就像沙子,單個來看也許毫無價值可言,沒有進行技術辨別、提純的時候,它們就是一盤散沙。但是當數(shù)據(jù)量足夠大,并且有技術能夠把它們利用起來時,這些數(shù)據(jù)的價值就會急劇上升,猶如沙子變成了黃金。
隨著生命科學及轉化醫(yī)學研究的不斷深入,王偉業(yè)相信,未來人們再談生物樣本庫時,重點會轉移到樣本庫的信息化建設上。
如何打造信息時代下的生物樣本庫,復旦大學生物醫(yī)學研究院教授劉雷認為,有序的空間管理才是樣本庫信息化管理的初衷,而條形碼等技術手段是信息管理所必不可少的。
“當樣本量積累到一定程度時,手工管理會變得很凌亂,極易造成錯誤。在這種情況下,應用條形碼等技術可以準確定位每個樣本,使空間管理自動化”劉雷指出,在樣本的收集、處理、出/入庫等操作流程中,應用條形碼等技術還可在樣本庫信息系統(tǒng)中準確了解樣本的狀態(tài),使管理自動化。
要想做到信息共享,劉雷認為引入云信息管理系統(tǒng)也是重要前提。生物樣本庫在共享機制下建立一個基于網(wǎng)絡化的樣本公共平臺,囊括多家網(wǎng)絡單位的生物樣本庫信息,可以實現(xiàn)樣本臨床數(shù)據(jù)、科研數(shù)據(jù)即時反饋,從而促進科研合作共享,提高樣本的使用效率。
另外,數(shù)據(jù)安全也是樣本庫信息管理中的重要部分,這就要求樣本庫信息系統(tǒng)有較完善的權限管理功能和操作記錄功能,可追蹤數(shù)據(jù)操作中的每一步。
北京大學腫瘤醫(yī)院教授呂有勇則認為,許多生物樣本采集工作基本上是根據(jù)科研工作的需要,由醫(yī)療機構和科研人員自發(fā)開展的,缺乏專業(yè)和系統(tǒng)的設計與規(guī)范,因此生物樣本庫還應該基于大數(shù)據(jù)時代的特征進行建設。
“大數(shù)據(jù)是獲得新認知和創(chuàng)造新價值的源泉,并將海量的生物樣本數(shù)據(jù)進行智能分析和科學利用。”呂有勇說。
質(zhì)量是樣本庫的靈魂
業(yè)界共識是,保證樣本的質(zhì)量才是生物樣本庫信息化建設的前提。在此次會議上,與會專家還共同呼吁,由政府組織,主動、集中地打造有序、可控、符合國際標準、高質(zhì)量、珍貴且可充分利用、產(chǎn)生重大應用價值的生物樣本庫勢在必行。
“樣本的質(zhì)量是樣本庫的靈魂,沒有質(zhì)量的樣本給研究結果帶來的負面影響要在相當長的時間內(nèi)才能消除。”復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院教授杜祥發(fā)出警告。
如何開展生物樣本庫的質(zhì)量管理,杜祥認為,樣本庫的質(zhì)量管理需要嚴格的操作流程作為保障,建立樣本庫標準作業(yè)程序(SOP)至關重要。
來自上海醫(yī)藥(601607,股吧)臨床研究中心的范錦立博士也持類似觀點。他認為樣本庫的運營應嚴格按照SOP,參加專業(yè)機構組織的抽樣質(zhì)控和檢查,持續(xù)改進樣本庫的質(zhì)量管理。另外,關注樣本操作流程的質(zhì)量控制點也非常重要,特別是溫度監(jiān)控以及核酸和細胞等物質(zhì)的質(zhì)量控制。
崔東紅則表示,個性化是生物樣本庫質(zhì)量的靈魂,要根據(jù)不同疾病特征建設有特色的個性化樣本庫。與此同時,穩(wěn)步發(fā)展是樣本質(zhì)控的方向,在滿足和保證質(zhì)量的前提下,有計劃地擴大庫存量,不可一味要求樣本庫存量。